主角暮光闪闪被宇宙公主派往小马谷学习友谊。她与五位新朋友（云宝黛西、苹果嘉儿、珍奇、柔柔、碧琪）共同对抗梦魇之月，并发现她们各自代表一种“和谐元素”。本季以单元剧形式展开，每集探讨友谊的不同课题，如诚实、慷慨、忠诚等

这部系列片将集中讲述阳光星探和她的朋友在电影中描述的事件之后的冒险经历。

友谊任务拓展至国际，探索不同地区的文化矛盾（如狮鹫的贪婪、斑马的偏见）。暮光尝试建立“友谊学校”，为后续季铺垫。本季以单元剧为主，深入挖掘配角背景故事。

坎特拉高中这次将与死对头－水晶预备高校（Crystal Prep Academy）进行一场学校间的‘友谊竞赛’，但Sunset Shimmer与朋友们却发现人类世界的Twilight Sparkle竟是水晶预备高校的学生，过去熟悉的同伴，这一次成了竞争对手，而且她们发现，Twilight Sparkle身上似乎有个天大的秘密......

小马紫悦为了执行导师宇宙公主给她的任务，与助手穗龙一起来到小马谷学习有关友谊魔法的知识，在学习和生活的过程中她结识了五位好朋友，并获得了真正的友谊，与朋友们共同守护小马利亚。

有一群关系亲密的小马们共同居住在梅尔湾，他们分别是赫克开拓者、伊兹月虹、花瓣皮普、奇普风暴和阳光星探。 赫克开拓者是梅尔湾的治安官，致力于帮助每一只小马，并时刻谨记遵守所有规则。因此，他在梅尔湾非常受欢迎和受人尊敬。然而，他有时会比较傲慢自负。伊兹月虹积极乐观，拥有无限精力，且富有创造力，喜欢使用回收材料创造新的手工艺品，花瓣皮普自信、时尚、迷人，是一位有才华的流行歌星，世界是她的舞台。奇普风暴热爱运动，叛逆且个性。同时，她崇尚科学，渴求知识。阳光星探是一匹好奇、冒险和理想主义的小马，决心让世界变得更美好。他们在梅尔湾相遇相识，一起经历了非常多有趣的故事，每匹小马都曾碰到过能让他们笑得肚子疼都停不下来的趣事。

动画讲述了一只名叫做暮光闪闪/紫悦（Twilight Sparkle）的独角兽，要执行她导师塞拉斯缇娅公主/宇宙公主（Princess Celestia）的任务，在小马镇/小马谷（Ponyville）学习关于友谊的知识。她与另外五只小马，苹果杰克/苹果嘉儿（Applejack）、瑞瑞/珍奇（Rarity）、云宝黛西/云宝（Rainbow Dash）、小蝶/柔柔（Fluttershy）与萍琪/碧琪（Pinkie Pie），成为最要好的朋友。每只小马都分别代表了友谊的6个元素：诚实，慷慨，忠心，善良，欢笑，魔法，并在谐率水晶/和谐之元（Elements of Harmony）中，各自扮演着属于自己的重要角色。在动画中，随时可见她们在小马镇/小马谷（Ponyville）的种种冒险、奇遇、日常等等。同时，也在她们之间的互动和冲突中，寻找着最适合最合理的完美解决方案。 “尽管小马国并不太平，六位主角之间也常常有这样那样的问题，但是他们之间的真情对代，使得这个童话世界已经成为不少人心中理想的世外桃源。”

小马国与其他种族（幻形灵、狮鹫、牦牛等）的冲突成为主线。虫茧女王试图通过寄生控制小马国，最终被进化后的幻形灵王子“邪茧”击败。星光熠熠的救赎之路继续展开。

动画讲述了一只名叫做暮光闪闪/紫悦（Twilight Sparkle）的独角兽，要执行她导师塞拉斯缇娅公主/宇宙公主（Princess Celestia）的任务，在小马镇/小马谷（Ponyville）学习关于友谊的知识。她与另外五只小马，苹果杰克/苹果嘉儿（Applejack）、瑞瑞/珍奇（Rarity）、云宝黛西/云宝（Rainbow Dash）、小蝶/柔柔（Fluttershy）与萍琪/碧琪（Pinkie Pie），成为最要好的朋友。每只小马都分别代表了友谊的6个元素：诚实，慷慨，忠心，善良，欢笑，魔法，并在谐率水晶/和谐之元（Elements of Harmony）中，各自扮演着属于自己的重要角色。在动画中，随时可见她们在小马镇/小马谷（Ponyville）的种种冒险、奇遇、日常等等。同时，也在她们之间的互动和冲突中，寻找着最适合最合理的完美解决方案。 “尽管小马国并不太平，六位主角之间也常常有这样那样的问题，但是他们之间的真情对代，使得这个童话世界已经成为不少人心中理想的世外桃源。”

主角们发现谐律精华的起源——谐律之树，并从树中取得新力量。反派无序短暂洗白协助对抗黑晶王残余势力。季终暮光获得水晶城堡，标志友谊使命的正式化。